如果手机短信已经被永久删除，恢复起来可能会比较困难，但是可以尝试以下几种方法来尽可能地找回它们。
1、从备份中恢复：如果之前有备份手机数据，可以在备份中查找已删除的短信，不同的手机品牌和使用的备份工具可能有所不同，可以在手机设置或使用的备份软件中查找相关指南。
2、使用数据恢复软件：可以使用一些数据恢复软件来扫描手机，寻找可恢复的短信数据，Dr.fone、EaseUS等都是比较知名的数据恢复软件，但是需要注意，恢复效果可能会受到很多因素的影响，如删除时间、手机使用情况等。
3、运营商协助：如果删除的短信非常重要，可以向手机运营商寻求帮助，有些运营商可能可以协助找回已删除的短信，但是需要提供相应的证明和手续。
4、云服务同步恢复：如果开启了云服务同步功能，并且同步了短信数据，可以在云服务的恢复选项中查找已删除的短信，根据使用的云服务提供商的不同，恢复方法可能会有所不同。
需要注意的是，无论使用哪种方法，恢复效果都可能受到限制，为了避免数据丢失，最好定期备份手机数据，并谨慎处理重要信息。
方法仅供参考，如果问题仍未解决，建议咨询手机维修专业人员或相关恢复服务以获得更多帮助。
