在淘宝上修改已发货订单的电话号码，可以通过联系卖家或者联系物流客服进行处理。具体操作步骤如下。
联系卖家进行处理
1、打开淘宝订单，找到已发货的订单。
2、点击订单详情，查看物流信息。
3、找到物流信息中的快递员电话，联系快递员并说明想要修改电话号码的情况。
4、提供新的电话号码给快递员，让其与物流公司联系修改，也要告知卖家修改电话号码的情况，以便其跟进订单状态。
方法二：联系物流客服进行处理
1、打开淘宝订单，找到已发货的订单。
2、进入物流详情页面，找到物流公司的客服联系方式（电话、在线客服等）。
3、联系物流客服，说明想要修改收货电话的情况。
4、提供订单编号、原电话号码和新电话号码给客服，让其帮忙修改，客服会核实相关信息并进行修改，建议告知卖家修改电话号码的情况。
需要注意的是，修改电话号码的具体操作可能会因物流公司、订单状态等因素而有所不同，如果无法直接修改，可能需要按照物流公司的要求进行操作，例如填写相关表格、提供身份证明等，建议在修改电话号码前与卖家沟通确认，确保卖家能够及时了解并跟进订单状态。
