苹果手机短信自动消失可能有多种原因，以下是一些常见的原因和解决方法。
1、iMessage同步问题：如果开启了iMessage同步，在不同设备上的信息可能会同步删除，可以进入设置中的信息选项，关闭iMessage同步开关，也可以尝试退出并重新登录Apple ID账号。
2、未储存短信：如果短信没有保存或被手动删除，可以尝试使用iTunes恢复备份恢复短信数据，连接手机至电脑，打开iTunes，点击设备图标，选择“恢复备份”来恢复之前备份的数据，需要注意的是，恢复操作会覆盖当前手机上的所有数据，建议在操作前做好备份。
3、系统错误或软件冲突：有时系统错误或软件冲突也可能导致短信消失，可以尝试重启手机或更新系统版本来解决，如果安装了某些可能会冲突的软件，可以考虑卸载它们。
4、短信被自动过滤：iPhone的短信过滤功能可以过滤掉一些可能被识别为垃圾信息的短信，可以进入设置中的信息选项，检查过滤未知发件人选项是否开启，如果开启了这个功能，所有被标记为垃圾信息的短信都会被过滤掉，关闭这个功能即可恢复显示这些短信。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系苹果官方客服或前往苹果专卖店寻求帮助，在操作过程中，请注意备份重要数据以防止丢失。
