iPhone短信没有删除却不见了可能有以下几种原因。
1、可能是系统卡顿导致的短信消失，可以尝试重启手机或者恢复系统来解决这个问题。
2、可能存在iCloud同步问题，登录Apple ID后，进入iCloud中的信息选项，检查是否开启了同步开关，如果开启，其他设备上的短信会同步到此iPhone上，可以检查其他设备上的短信是否也消失了，也有可能是短信没有正常同步到iCloud上导致的消失，可以尝试关闭同步开关再重新打开，或者重新连接网络尝试同步，如果仍然无法恢复消失的短信，可以尝试还原所有设置或者升级系统来解决这个问题。
3、如果使用了某些第三方工具或软件管理短信，也可能导致短信消失，建议尝试不使用第三方工具，并查看是否有恢复短信的选项，备份也很重要，可以通过iTunes或iCloud备份手机数据以防止意外情况发生，如果短信仍然无法恢复，建议联系苹果客服寻求帮助。
只是一些可能的原因和解决方法，具体情况可能因个人使用情况而异，如果问题仍然存在，建议寻求专业的技术支持。
