收到短信提示银行卡透支，可能是由于实际发生了透支消费或者银行出现了误判。在这种情况下，可以按照以下步骤来处理。
1、确认短信的真实性：不排除存在诈骗短信的可能，因此首先要确认短信是否来自银行官方。
2、登录银行官网或APP：输入个人账号信息后查看具体的消费记录和透支情况，以了解实际情况。
3、核实消费记录：如果发现存在非本人的消费记录，可能是银行卡被盗刷，需要立刻联系银行客服进行挂失并报警处理。
4、还款处理：如果确认存在透支情况，需要尽快还清欠款，可以选择通过银行转账、ATM机还款等方式进行还款。
5、联系银行客服：如果短信是误判，或者对透支情况有任何疑问，可以直接联系银行客服进行咨询和申诉。
6、保持良好的沟通：如果确实发生了透支情况，需要与银行保持良好的沟通，避免产生更多的利息和罚款。
收到短信提示银行卡透支后，一定要保持冷静并及时采取措施，确保个人财产安全，如有任何疑问，都可以直接联系银行客服进行咨询。
