苹果手机短信无故消失然后恢复，可能有以下几种原因。
1、iMessage同步：若在手机设置中开启了iMessage同步，两部手机会同步共享相同的短信，若其中一部手机删除短信，另一部手机中的相应短信也会消失，但如果在一段时间后重新同步，已删除的短信可能会再次恢复，建议检查是否无意中触碰到了同步按钮。
2、系统错误或Bug：手机的系统有时会出现错误或Bug，可能导致短信消失，但经过系统更新或重启后，这些错误可能会被修复，导致短信重新出现。
3、第三方应用干扰：某些第三方应用可能会对短信进行备份或同步操作，如果使用了这样的应用并删除了短信，之后再卸载或更改设置，可能导致短信恢复，建议检查手机中安装的第三方应用，并尝试卸载最近安装或进行更改的应用。
4、未真正删除：可能并未真正彻底删除短信，可以通过重新操作来确保短信被彻底删除。
如果以上原因都排除，还存在短信消失和恢复的情况，建议咨询苹果官方客服寻求进一步的帮助，也可以考虑备份手机数据以防止重要信息丢失。
