如果苹果手机上的短信已经被删除，并且无法恢复，可以考虑以下几种方法来处理这种情况。
1、备份恢复：如果您定期备份您的iPhone，那么您可能能够在备份中恢复已删除的短信，使用iTunes或iCloud备份恢复数据时，请注意选择正确的备份文件，以免覆盖当前手机上的数据。
2、使用恢复软件：市面上有一些第三方恢复软件，如EaseUS MobiSaver等，这些软件可能能够帮助您找回已删除的短信，但使用这些软件时，请确保从官方可信来源下载，并注意数据隐私。
3、联系运营商：在某些情况下，您可能能够通过联系手机运营商来恢复已删除的短信，但这取决于短信删除的时间以及运营商的政策。
4、寻求专业帮助：如果以上方法都无法恢复删除的短信，您可以考虑寻求专业技术人员的帮助，他们可能有更专业的工具和方法来恢复数据。
数据恢复的成功率取决于多种因素，包括数据删除的时间、手机使用情况以及数据恢复方法的适用性，建议定期备份重要数据，以避免数据丢失的风险，为了避免将来再次发生类似情况，建议定期清理不需要的短信，并将重要短信备份到iCloud或其他地方。
