运营商发短信查轨迹是否违法，需要根据具体情况而定。
如果运营商在得到相关部门的授权后，按照法定程序进行轨迹查询，那么这种行为是合法的，公安机关在调查案件时，可以要求运营商提供用户的通信轨迹信息，以便追踪犯罪嫌疑人的行踪，在这种情况下，运营商发送短信查轨迹是为了协助相关部门进行合法调查，不违反法律规定。
如果运营商未经用户同意或者相关部门授权，擅自将用户的轨迹信息用于商业目的或者其他非法目的，那么这种行为就涉嫌侵犯用户的隐私权和个人信息，是违法的，如果运营商在查询轨迹的过程中存在滥用职权、泄露用户隐私等行为，也可能会被认定为违法行为。
需要具体问题具体分析，建议在使用此类服务时，了解相关法律法规和政策规定，保护自己的合法权益，如有疑虑，可以咨询专业律师或相关机构获取权威解答。
