手机主题无法应用于短信应用的原因可能有以下几点。
1、主题设计不支持短信应用：有些手机主题可能只针对手机的主要界面进行设计，而不包括短信应用或其他特定应用的界面，即使更换了主题，短信应用的界面可能仍然保持不变。
2、短信应用界面定制受限：部分手机制造商或操作系统可能对短信应用的界面定制进行限制，以保护用户体验和信息安全，这种情况下，即使主题设计包含了短信应用的界面设计，也无法应用到实际的短信应用中。
3、主题文件不兼容：如果下载的主题文件与手机型号或操作系统版本不兼容，也可能导致主题无法应用到短信应用，如果主题文件损坏或不完整，也可能导致应用失败。
4、手机系统权限限制：在安装并应用主题时，需要确保手机系统有足够的权限允许安装和更改应用界面，如果权限设置不当，可能导致主题无法应用到某些应用。
针对以上原因，可以尝试以下解决方法：
1、检查主题设计是否包含短信应用的界面设计，并确认主题是否适用于手机型号和操作系统版本。
2、尝试下载其他主题，看是否能够成功应用到短信应用。
3、检查手机系统的权限设置，确保允许安装和更改应用界面。
4、如果问题仍然存在，建议联系手机制造商或运营商的客服支持，寻求进一步的帮助和解决方案。
