注册公司代理记账的费用通常由公司承担。因为代理记账服务属于公司运营过程中的一项必要支出，类似于雇佣全职会计人员的工资支出，只是代理记账服务是通过外部机构提供的专业服务。因此，这笔费用被视为公司经营成本的一部分，通常由公司承担。
具体由谁承担代理记账费用还需结合公司的实际情况和内部规定来看，如果公司有相关预算或特定规定，可能会按照不同的规定来执行，在某些情况下，初创公司或小公司可能会选择由股东或创始人承担部分或全部代理记账费用，但这并非普遍做法，建议在注册公司前与公司股东或相关责任人明确代理记账费用的承担方式，以避免后续纠纷。
代理记账的具体费用可能因公司规模、业务复杂程度、代理机构的资质和服务内容等因素而有所不同，在选择代理机构时，除了考虑费用因素，还应关注其专业资质和服务质量。
信息仅供参考，如有更多疑问，建议咨询专业律师或代理机构。
