刷机后短信是否还在，取决于刷机的方式和手机的存储机制。一般来说，如果进行了全盘刷机，那么手机内的所有数据（包括短信）可能会被清空。但如果只是进行了简单的系统更新或者部分刷机，那么短信可能会保留。
如果不幸遇到刷机后短信丢失的情况，可以尝试以下方法来恢复：
1、如果之前有备份手机数据的好习惯，那么可以通过备份恢复工具来恢复短信，这通常涉及到连接手机到电脑，然后使用备份软件来恢复数据，具体的恢复方法取决于所使用的备份软件和手机型号。
2、如果手机开启了云服务功能，并且同步了短信数据，那么可以尝试登录云服务账号来找回短信。
3、使用专业的数据恢复软件来尝试恢复手机丢失的短信，这些软件可以扫描手机的存储芯片，尝试找回被删除的数据，但请注意，使用这种方式恢复的数据可能会因为后续数据的写入而被覆盖，所以越早使用此方法恢复成功率越高。
在进行任何数据恢复操作之前，请确保备份当前手机数据以防止进一步丢失，由于不同品牌和型号的手机可能存在差异，建议查阅相关手机的官方说明或者咨询专业人员以获取更准确的建议，如果无法自行恢复，建议寻求专业技术人员的帮助。
