手机桌面上短信提示消失可能有多种原因，以下是一些可能的原因和解决方法。
1、短信应用被停止或优化：请检查手机中的短信应用是否被停止或优化，有些手机为了节省资源，会自动停止或优化一些不常用的应用，导致短信提示消失，可以在应用管理或设置中找到短信应用，确保它在后台运行或被允许自启动。
2、系统通知权限：检查短信应用的通知权限是否被关闭，可以在手机的设置中找到通知管理或者通知权限，确保短信应用的通知权限已经开启。
3、短信设置：检查短信设置是否正确，有些手机中，可能需要开启某些短信设置才能接收通知，例如短信铃声、震动等，可以在短信应用内部设置中进行检查。
4、桌面主题或布局问题：如果使用的是第三方桌面应用，可能会导致短信提示图标不显示，可以尝试更换回默认桌面主题或布局，看看是否能够解决问题。
5、软件冲突或系统问题：如果以上方法都没有解决问题，可能是软件冲突或系统问题导致的，可以尝试重启手机或者恢复出厂设置，看看是否能够解决问题，如果问题依然存在，可能需要刷机或者去售后服务中心寻求帮助。
针对手机桌面上短信提示消失的问题，需要逐一排查可能的原因，并尝试相应的解决方法，如果问题依然存在，建议寻求专业人士的帮助。
