苹果手机短信消失的原因可能有以下几种。
1、可能是用户不小心删除了短信，或者将短信应用进程关闭导致的，这种情况可以尝试重新打开短信应用或者从备份中恢复已删除的短信。
2、手机系统问题，可以尝试重启手机或者更新手机系统来解决。
3、短信应用自身的问题，可以进入手机的设置，找到短信应用，点击“短信回收站”或“垃圾箱”，查看是否有误删的短信，有时在删除短信后，可能会在短信的垃圾箱中保留一段时间。
4、手机存储空间不足也可能导致短信消失，可以尝试删除一些不必要的文件或应用，清理手机存储空间。
5、如果使用了第三方短信应用，也有可能是第三方应用的问题导致的短信消失，可以尝试更换其他短信应用或者检查该应用的设置和权限。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系苹果官方客服或者前往苹果专卖店进行检查和维修。
