苹果还原所有设置后，短信是否还在以及是否安全，取决于具体的操作。
1、如果选择“还原所有设置”，这仅仅会重置设备的设置，包括壁纸、网络设置、APP设置等，但不会删除任何数据或媒体文件，因此短信应该会保留。
2、如果选择“抹掉所有内容和设置”，则所有内部数据（包括短信）都会被彻底清除，并且此后安全，这种情况下，数据已经被彻底删除，无法通过正常途径恢复，虽然有一些数据恢复软件可能声称可以恢复这些数据，但实际效果并不确定，而且可能存在风险，如数据泄露或隐私安全问题，在使用此类软件时要谨慎。
还原所有设置不会删除数据或影响数据安全，但如果选择抹掉所有内容，则数据会被彻底清除且难以恢复，在操作过程中要确保了解并确认自己的选择，如有更多疑问，可以咨询苹果官方客服或在专业人士的指导下操作。
