对于已删除的短信的恢复，可以尝试以下方法。
1、使用iTunes备份恢复：如果之前有使用iTunes备份过手机数据，那么可以通过iTunes恢复备份来找回已删除的短信，连接iPhone到电脑，打开iTunes并识别设备后，选择“恢复备份”选项来恢复数据。
2、使用iCloud备份恢复：如果开启了iCloud备份功能并已经备份了短信数据，那么可以通过iCloud备份恢复已删除的短信，进入iPhone的设置，选择“通用”-“还原”-“从iCloud备份恢复”。
3、使用第三方软件恢复：市面上存在一些第三方软件如开心手机恢复大师等，可以扫描手机中的碎片文件来尝试恢复已删除的短信，需要在电脑端操作，并且可能需要越狱权限，但请注意，使用第三方软件可能存在风险，需要谨慎操作。
至于苹果系统还原后数据的恢复问题，系统还原会清除手机上的所有数据和设置，包括已删除的短信，如果之前没有进行备份，那么可能无法恢复这些已删除的数据，建议定期备份重要数据以避免此类情况的发生。
方法仅供参考，如果数据非常重要且无法自行恢复，建议寻求专业数据恢复服务的帮助，为了避免数据丢失，建议定期备份设备并妥善保管。
