设置手机短信的指纹支付功能通常涉及的是支付应用（如支付宝、微信等）的指纹支付设置，而不是直接通过短信应用进行设置。以下是常见的支付应用中设置指纹支付的一般步骤。
1、打开支付宝应用并登录账号。
2、进入“我的”页面。
3、点击“设置”或“安全设置”。
4、在该页面找到“指纹支付”或“生物支付”选项。
5、点击进入后，按照提示录入指纹信息。
6、完成录入后，开启指纹支付开关。
以微信为例：
1、登录微信后，进入“我”的页面。
2、点击“钱包”或“支付”选项。
3、进入支付设置页面。
4、在该页面找到“指纹支付”或“生物支付”选项。
5、点击进入后，按照提示操作并验证指纹信息。
6、完成设置后，即可使用指纹进行支付。
具体的步骤可能会因应用版本、手机型号或操作系统不同而有所差异，为了确保顺利设置，建议查看具体应用的官方教程或帮助文档，确保手机的指纹识别功能已经启用并正常工作，且手机的操作系统与支付应用是兼容的。
至于短信应用，短信应用本身并不提供指纹支付功能，指纹支付主要是在支付应用中用于验证支付操作的安全性，如有其他关于短信应用的特定问题，请继续询问。
