如果您收到了汇款短信通知，但是电话费用被扣在了对方的电话上，您可以采取以下措施。
1、确认短信的真实性：首先确认短信是否真实可靠，避免遭受诈骗，您可以通过其他途径核实短信内容，比如联系银行或相关机构确认汇款情况。
2、联系银行或支付机构：如果您确认短信是真实的，可以联系银行或支付机构客服，向他们说明情况并寻求帮助，他们可以帮助您查明款项的流向和扣款情况，并给出相应的解决方案。
3、联系对方电话运营商：如果您确认电话费用被误扣在了对方的电话上，您可以尝试联系对方的电话运营商，向他们说明情况并要求他们协助处理，他们可能需要核实身份和相关信息，以便确认您的请求。
4、协商解决：如果电话费用被扣的情况比较轻微，您也可以尝试与对方协商解决，您可以与对方沟通并说明情况，请求对方协助处理电话费用问题，如果对方同意协助处理，可以协商解决方案并达成共识。
无论采取哪种方式，建议您保留好相关证据和记录，以便在处理过程中提供证明，也要注意保护个人信息和账户安全，避免遭受诈骗或其他损失。
