手机刷机时，由于数据被清除，已删除的短信可能无法恢复。但是，如果刷机前已经对短信进行了备份，可以尝试以下方法恢复。
1、从备份恢复：如果使用的是手机品牌的云备份服务或第三方备份软件，可以尝试登录相应账号，找到备份数据并恢复短信。
2、使用数据恢复软件：可以尝试使用一些数据恢复软件来找回删除的短信，使用卓师兄、手机数据恢复精灵等软件来扫描手机存储空间，找回已删除的短信。
3、同步iCloud备份恢复短信：如果使用iPhone并且已经开启了iCloud备份功能，可以尝试通过以下步骤恢复短信：
打开iPhone设置。
点击顶部的个人信息，进入Apple ID页面。
在Apple ID页面中找到“iCloud”选项，进入备份功能页面。
选择“从iCloud云备份恢复”，找到需要恢复的备份文件并下载。
重启设备后，连接WiFi并选择恢复数据选项，等待恢复过程完成即可。
这些方法并不一定能够完全恢复所有已删除的短信，因为刷机过程中数据被清除是不可逆的，在尝试恢复数据时，请确保选择可信任的软件和服务，避免造成进一步的损失，如果无法自行恢复数据，建议寻求专业技术人员的帮助。
