如果苹果手机中的短信已经被删除，恢复已删除的信息可能比较困难。不过，可以尝试以下方法。
1、iTunes备份恢复：如果之前有使用iTunes备份手机，可以通过恢复备份来找回删除的短信。
2、iCloud备份恢复：如果开启了iCloud备份，也可以尝试从iCloud备份恢复删除的短信。
3、使用第三方软件恢复：有一些第三方软件可以扫描并恢复已删除的短信，但需要注意选择正规和安全的软件，以免泄露个人信息。
至于回复已删除的短信，由于短信已经被删除，所以无法直接在手机中进行回复，如果仍然需要与发送者沟通，可以通过其他方式如电话、邮件或社交媒体来联系对方，告知对方之前的短信内容以及想要传达的信息。
方法仅供参考，如果仍然无法恢复或回复短信，建议咨询苹果官方客服寻求更多帮助。
