如果您在iPhone上删除了短信，但仍然看到短信应用中的红色标记或未读标记，这可能是因为以下原因。
1、通知设置：即使您删除了短信，通知中心的通知可能仍然存在，您可以前往“设置”中的“通知”部分，找到“信息”应用，并关闭相关的通知标记选项，这样，即使短信被删除，也不会再显示标记。
2、短信中的对话标记：在某些情况下，即使您删除了某些短信，与该联系人的对话可能仍然显示为未解决或有标记，这可能是因为在对话中有未读的消息或特定的对话标记功能导致的，您可以尝试清除所有未读消息或检查是否有其他功能导致这种情况。
3、软件问题或缓存问题：有时，iPhone的软件或缓存可能会出现问题，导致标记显示不正确，您可以尝试重启设备或更新iOS系统，看看问题是否得到解决。
如果您尝试了上述方法但仍然无法解决问题，建议您联系苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求帮助，他们可能能够提供更具体的解决方案或建议。
