支付宝花呗已经还款了，但仍然收到还款短信通知，可能存在以下几种情况。
1、短信延迟：有时由于网络或系统原因，短信可能会延迟发送，如果已经确认已经还款，这条短信可能是前一天的或者更久的。
2、系统错误：可能支付宝系统出现了短暂的错误，误认为你尚未还款。
3、他人花呗付款：可能别人在使用花呗付款时，收货手机号填写错误，成为了你的支付宝账号，当对方还款时，支付宝会向你发送短信提醒。
4、未还清的账单：如果花呗账单分期还款或者存在部分账单未还清的情况，可能还存在未还的账单欠款，在还清部分账单后，支付宝会发送提醒短信。
如果收到这样的短信，建议登录支付宝仔细核对花呗账单，确认是否已经还清，如果确认已经还清所有款项，但仍然收到短信，可以联系支付宝客服进行咨询，也要注意短信内容，避免诈骗信息，对于涉及金钱的短信，一定要谨慎对待，确保自己的账户安全。
