要彻底删除苹果手机上的短信，您可以按照以下步骤操作。
1、直接在短信应用中进行删除：打开短信应用，长按想要删除的短信，会出现“删除”选项，点击即可删除该短信，这种方式删除的短信可以在最近删除中找到，如果想要彻底删除，需要在最近删除中再次选择删除。
2、通过iTunes备份恢复后删除：连接iPhone到电脑上，用iTunes备份手机数据，再恢复备份，恢复完成后，在手机短信应用中清空全部短信，完成这一操作后，即便备份中还有短信记录，手机中也不会再显示。
3、使用第三方软件删除：可以使用一些第三方软件来删除短信，例如使用同步助手等工具，可以批量删除短信，这种方式同样可以达到彻底删除的目的。
需要注意的是，无论采用哪种方式删除短信，一旦删除就无法恢复，在删除之前请确保您不需要这些短信了，如果您想保护个人隐私，建议定期清理手机中的短信和其他数据。
